La composición del microbioma intestinal se ha asociado con las respuestas clínicas al tratamiento con inhibidores de puntos de control inmunitarios (ICI), pero existe un consenso limitado sobre las características específicas del microbioma vinculadas a los beneficios clínicos de los ICI. Realizamos la secuenciación metagenómica de muestras de heces recogidas antes del inicio de los ICI en cinco cohortes de observación que reclutaron a pacientes sin ICI con melanoma cutáneo avanzado (n = 165).

Al integrar el conjunto de datos con 147 muestras metagenómicas de estudios publicados anteriormente, descubrimos que el microbioma intestinal tiene una asociación relevante, aunque dependiente de la cohorte, con la respuesta a los ICI. Un análisis de aprendizaje automático confirmó la relación entre el microbioma y las tasas de respuesta global (ORR) y la supervivencia sin progresión (PFS) con ICI, pero también reveló una reproducibilidad limitada de las firmas basadas en el microbioma entre cohortes.

En consecuencia, se identificó un panel de especies, entre las que se encuentran Bifidobacterium pseudocatenulatum, Roseburia spp. y Akkermansia muciniphila, asociadas a los respondedores, pero no se pudo considerar que una sola especie fuera un biomarcador totalmente consistente en todos los estudios.

En general, el papel del microbioma intestinal humano en la respuesta a la ICI parece ser más complejo de lo que se pensaba, y va más allá de las diferentes especies microbianas simplemente presentes o ausentes en los que responden y en los que no responden. Los estudios futuros deberán adoptar tamaños de muestra mayores y tener en cuenta la compleja interacción de los factores clínicos con el microbioma intestinal a lo largo del tratamiento.

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