De referencia en personas sanas y plantilla de informes estándar
Es necesario un conocimiento exhaustivo de los tipos y proporciones de microbios que habitan en el intestino humano sano, antes de que se pueda realizar cualquier tipo de estudio preclínico o clínico, que intente alterar el microbioma para tratar una afección o mejorar el resultado de la terapia.
Para abordar esta necesidad, presentamos un flujo de trabajo de análisis integral innovador y escalable. Una lista de microbiomas de referencia humana saludable y un perfil de abundancia (GutFeelingKB), y un nuevo Informe de población de bioma fecal (FecalBiome) con aplicabilidad clínica.
GutFeelingKB proporciona una lista de 157 organismos (8 filos, 18 clases, 23 órdenes, 38 familias, 59 géneros y 109 especies) que forman el bioma basal y, por lo tanto, pueden usarse como controles saludables para estudios relacionados con la disbiosis.
Esta lista se puede ampliar a 863 organismos si se consideran proteomas estrechamente relacionados. La incorporación de la ciencia del microbioma en la práctica clínica de rutina requiere un informe estándar para comparar el microbioma de un individuo con la creciente base de conocimiento de datos de microbioma «normales».
El FecalBiome y la tecnología subyacente de GutFeelingKB abordan esta necesidad. La base de conocimiento puede ser útil para las agencias reguladoras para la evaluación del trasplante fecal y otros productos de microbioma, ya que contiene una lista de organismos de individuos sanos.
Además de la lista de organismos y sus abundancias, este estudio también generó una colección de secuencias contiguas ensambladas (contigs) de materia oscura metagenómica.
En este estudio, la materia oscura metagenómica representa secuencias que no se pueden mapear a ninguna secuencia conocida, pero se pueden ensamblar en contigs de 10,000 nucleótidos o más. Estas secuencias se pueden usar para crear cebadores para estudiar posibles nuevos organismos.
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