El microbioma se refiere a la recopilación de todas las secuencias genéticas de una comunidad de microbios en el cuerpo humano. Las tecnologías de amplificación y secuenciación de ADN de alto rendimiento para caracterizar las comunidades microbianas proporcionan datos para las investigaciones de asociaciones microbianas con enfermedades humanas. Nuestro objetivo es crear y utilizar cohortes establecidas y nuevas con muestras fecales y orales para evaluar prospectivamente la asociación entre el microbioma humano y el riesgo de cáncer.

Si bien la investigación sobre el microbioma ha crecido exponencialmente en los últimos años, los hallazgos han sido difíciles de reproducir en los estudios. La variabilidad inducida por la recolección y el manejo de muestras no se ha evaluado sistemáticamente. Por lo tanto, además de los estudios etiológicos, los investigadores de DCEG están aplicando un enfoque multifa para abordar los problemas metodológicos del microbioma para validar la recopilación, el almacenamiento y el análisis óptimos y para entender cómo interpretar mejor los datos complejos.

Estudios etiológicos

Estudio del Dr. Emily Vogtmann sugiere que los factores de riesgo de cáncer de pulmón incluyen bacterias orales.

Estudio prospectivo del microbioma oral y la mortalidad y el cáncer: La mala salud e higiene bucal se han asociado con una serie de cánceres, mortalidad y otras enfermedades crónicas, lo que sugiere un papel para el microbioma oral en el desarrollo de estas afecciones, pero pocos estudios han examinado medidas directas de las bacterias. Los investigadores de DCEG están evaluando la asociación entre el microbioma oral y los cánceres incidentes del bronquio/pulmón, el colorrectal, el esófago, la cabeza/cuello, el tracto hepatobiliario, el páncreas, el intestino delgado y el estómago, y la mortalidad por todas las causas, utilizando un diseño de casos y cohorte dentro del Estudio de Salud Este proyecto multicáncer y multicohorte nos permite probar varias hipótesis simultáneamente, proporcionar una mayor visión del papel del microbioma oral en el cáncer en varios sitios e investigar asociaciones transversales con diversas exposiciones como la dieta, el índice de masa corporal y el tabaquismo.

Estudios de cáncer gastrointestinal inferior: La asociación entre el microbioma intestinal humano y el cáncer colorrectal es un foco importante de nuestra investigación. Realizamos secuenciación de genes ribosomales 16S y secuenciación de escopeta para análisis de microbioma del colorectum utilizando muestras fecales, así como muestras de tejido. También evaluamos los metabolitos microbianos en las muestras de sangre y fecales.

Estudios de cáncer gastrointestinal superior: el cáncer gástrico es actualmente el modelo de cáncer asociado bacterianamente; Helicobacter pylori (H. pylori) ha sido clasificado como carcinógeno del Grupo 1 en humanos por la Agencia Internacional de Investigación sobre el Cáncer, lo que indica agentes con el más alto nivel de evidencia epidemiológica y mecanicista. La investigación dentro de DCEG ha evaluado cómo los factores de riesgo para el cáncer, como el tabaco, el índice de masa corporal y los niveles de pepsinógeno, se asocian con la diversidad microbiana utilizando muestras recogidas en China. Hemos probado múltiples métodos para recoger el microbioma de tejido en el tracto gastrointestinal superior y hemos explorado el microbioma de los tumores y el tejido normal adyacente. Nuevos estudios explorarán cómo H. pylori y otros carcinógenos de la GI superior alteran el microbioma del tejido gástrico y esofágico, si el microbioma tumoral puede proporcionar información diagnóstica o pronóstica para los cánceres gastrointestinales superiores, y evaluarán las asociaciones entre el microbioma oral y el riesgo de cáncer gastrointestinal superior en estudios prospectivos.

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