Los factores microbios han estado implicados en el riesgo de cáncer, la progresión de la enfermedad, el tratamiento y la prevención. La palabra clave, sin embargo, es «implicado». Nuestro objetivo en este documento es trazar algunas de las tensiones entre los métodos, objetivos y estándares de evidencia que compiten en la investigación del cáncer con respecto al papel causal de los factores microbianos. Discutimos una serie de compensaciones pragmáticas y epistémicas en esta área de investigación: priorizar las explicaciones de grano grueso frente a las de grano fino de los roles de la microbiota en el cáncer; explicar los objetivos generales frente a los específicos del cáncer; estudiar los organismos modelo frente a los pacientes humanos; y comprender y explicar el cáncer frente al desarrollo de herramientas y tratamientos de diagnóstico. A la luz de estas compensaciones y de la complejidad y heterogeneidad distintivas en ambos lados de la relación microbioma-cáncer, sugerimos que sería más productivo e intelectualmente honesto enmarcar gran parte de este trabajo, al menos actualmente, en términos de generar hipótesis causales para investigar más a fondo. En muchos casos, las afirmaciones sobre las conexiones causales establecidas entre el microbioma y el cáncer están exageradas. También discutimos el valor de las variables causales microbianas del «boxeo negro» en este contexto de investigación y sacamos algunas lecciones generales de precaución para las discusiones en curso sobre los microbiomas y el cáncer.

Varios taxones microbianos específicos desempeñan papeles causales conocidos en el inicio de tipos específicos de cáncer.2 Además, hay un creciente cuerpo de trabajo que busca comprender hasta qué punto nuestros microbiomas, las comunidades microbianas que viven en y sobre organismos anfitriones como nosotros, podrían desempeñar un papel en la promoción, prevención, progresión y probabilidad de recurrencia del cáncer (McQuade et al., Esta investigación se centra especialmente en el potencial de desarrollar tratamientos personalizados para mitigar los impactos dañinos, o promover impactos beneficiosos, de estados de microbioma o firmas composicionales particulares.3

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